El MCP-Ecuador es una instancia de coordinación y consenso multisectorial, en el que participan, representantes de los sectores de la sociedad civil, del sector académico, sectores no públicos, representantes de instituciones del Estado y organizaciones de cooperación internacional, cuya finalidad es contribuir a la respuesta nacional contra el VIH/Sida, la Tuberculosis y la Malaria, en el marco de las políticas y planes estratégicos de país.

Se constituyó en septiembre del 2002, bajo el liderazgo del Ministerio de Salud Pública y con el apoyo de la cooperación internacional, como un ente de decisión técnica y política, sin necesidad de personería jurídica, con autonomía administrativa y financiera, bajo los lineamientos del FM.