• Contribuir a la mejora de la salud de la población ecuatoriana a través de la disminución en el impacto del VIH/Sida, Tuberculosis y Malaria.
  • Fortalecer la participación y movilización de la comunidad organizada en el diseño e implementación de las propuestas nacionales en las tres epidemias y así lograr una adecuada coordinación intersectorial e interinstitucional.
  • Supervisar el uso eficiente, equitativo y transparente de los recursos asignados por el FM para la prevención y control del VIH/Sida, Tuberculosis y Malaria, e incidir en la reducción del estigma y la discriminación a personas afectadas por las tres epidemias.